Ученые оценят функцию тысяч генов в клетках домашних свиней и бородавочников в поисках устойчивости к АЧС

Вирус африканской чумы свиней (ВАЧС) — смертельно опасный патоген, который угрожает глобальным поставкам мяса домашних свиней, но не вызывает заболеваний у диких африканских свиней.

Борьба с африканской чумой свиней ограничивается забоем и карантином для инфицированных животных из-за отсутствия безопасной и эффективной вакцины, что приводит к серьёзным экономическим потерям. Хотя исследования по борьбе с АЧС были сосредоточены на свиньях, мало что известно об иммунном ответе африканских ред-риверских свиней или бородавочников, африканских животных, которые являются родственниками свиней, но не заболевают.

Ученые из Рослина разработали платформу на основе стволовых клеток (индуцированных плюрипотентных стволовых клеток), которая может генерировать макрофаги или иммунные клетки свиней и красных речных свиней — основную клеточную мишень вируса африканской чумы свиней. Этот проект реализуется совместно с коллегами из Национального научно-исследовательского института сельского хозяйства, продовольствия и окружающей среды (INRAE) во Франции, которые будут заниматься высокопроизводительной биоинформатикой и сравнительной геномикой, а также с Центром геномного регулирования (CRG) в Испании, который обладает опытом в области вирусологии, взаимодействия хозяина и патогена и секвенирования РНК отдельных клеток.

Проекты Pirbright и Roslin финансируются Министерством по делам окружающей среды, продовольствия и сельского хозяйства (Defra) в рамках Партнерства ЕС по охране здоровья и благополучия животных (EUPAHW), целью которого является обеспечение общества устойчивыми продуктами животноводства, птицеводства и аквакультуры.

Доктор Крис Нетертон, возглавляющий группу по вакцинологии против африканской чумы свиней в Пирбрайте, сказал: «Существует серьёзный пробел в знаниях, и наша цель — определить факторы, влияющие на устойчивость к вирусу африканской чумы свиней, и углубить наши знания о взаимодействии вируса африканской чумы свиней с организмом хозяина. «Мы предполагаем, что восприимчивость и устойчивость к вирусу африканской чумы свиней частично определяются внутренними характеристиками макрофагов и их врождённой реакцией. В рамках нашего проекта мы будем выявлять биомаркеры устойчивости, используя плюрипотентные стволовые клетки для определения факторов, регулирующих восприимчивость и устойчивость макрофагов к инфекции африканской чумы свиней». Доктор Финн Грей из Института Рослина сказал: «Наш опыт в области высокопроизводительного генетического скрининга в сочетании с передовыми методами изучения стволовых клеток, доступными в лаборатории доктора Тома Бёрдона, позволит нам одновременно оценить функции тысяч генов в клетках и выявить ключевые факторы, регулирующие вирус африканской чумы свиней». Доктор Фердинанд Рош, INRAE, сказал: «Мы рады сотрудничать с Пирбрайтом и другими партнёрами в рамках финансирования EUPAHW, чтобы помочь определить факторы восприимчивости и устойчивости к африканской чуме свиней у домашних и диких животных. Наш вклад поможет выявить связи между врождённым иммунитетом, выработкой цитокинов и взаимодействием между врождёнными иммунными системами, которые борются с вирусами и воспалением». Доктор Седрик Нотредам, CRG, добавил: «Недавнее обнаружение вируса африканской чумы свиней недалеко от Барселоны — яркое напоминание о том, что этот вирус всегда рядом. Понимание того, почему некоторые дикие свиньи могут быть носителями вируса, не заболевая при этом, крайне важно, если мы хотим предотвратить будущие вспышки, защитить местное биоразнообразие и обеспечить средства к существованию для фермеров».

Трехлетний проект в конечном итоге направлен на выявление ключевых генетических факторов, лежащих в основе устойчивости к АЧС, посредством сравнительного анализа домашних свиней и бородавочников с упором на врожденный иммунный ответ.

Группа вакцинологии африканской чумы свиней Пирбрайта занимается прикладными и фундаментальными исследованиями крупного ДНК-содержащего вируса, вызывающего африканскую чуму свиней (АЧС) — смертельное геморрагическое заболевание свиней и диких кабанов.